Dopo aver conquistato senza troppi problemi la pole, Casey Stoner è rimasto al comando per tutta la durata della gara di Misano. Subito dietro di lui sul podio, le due Suziki Rizla rispettivamente di Vermeulen e Hopkins. Ottimo quarto posto per Marco Melandri, nonostante la brutta caduta che lo ha visto protagonista sabato e i conseguenti dolori durante la corsa. Subito fuori invece de Puniet e Pedrosa, per un incidente alla prima curva. Rossi invece lascerà la gara la quinto giro, per un problema al nuovo motore della sua M1. Stessa sorte per Alex Barros, anche lui costretto al ritiro.